アズワン株式会社が日本の代理店として販売するエストニア・Bioatlas社製の「Atlas ClearSight Tablet」は、アガロース電気泳動用のゲル作製を手軽に作製できる、ひょう量不要のアガロースゲル作製用タブレットです。
アガロースゲル電気泳動用のゲル作製を素早く手軽に！Bioatlas社「Atlas ClearSight Tablet」
Bioatlas社について
Bioatlas社は、エストニアに所在する2006年創業の企業です。高品質な分子生物学研究用製品を製造販売し、「ワンストップショップ」となることで研究者が試薬にかける時間を削減し、その時間を研究に充てられるよう目指し、設立されました。
販売している製品には
・DNA染色試薬
・DNAポリメラーゼ
・PCRミックス／qPCRミックス
・RT-qPCR用キット
・PCR用バッファーと試薬類
・ヌクレオチド類
・電気泳動用試薬
などがあります。
アガロースゲル電気泳動とは？アガロースゲル電気泳動の原理とその歴史
アガロースとは寒天構成成分の一つで、寒天の元となる海藻から抽出・精製できます。このアガロースをゲル化すると網目状の構造ができます。電流と共に核酸（DNAやRNA）をゲル中で流すと、核酸の大きさによる網目状構造の通りやすさの違いから、核酸の塩基数（ベースペア；base pair）ごとの分離ができます。塩基数の多い（分子量の大きい）核酸の断片は構造内を通りにくいため移動時間が遅く（泳動距離が短く）、ゲルの上部で留まります。一方、塩基数の少ない核酸の断片は泳動距離が長くなり、ゲルの下部まで流れます。これら核酸の断片は染色試薬で可視化することができ、可視化にはエチジウムブロマイド（Ethidium Bromide；EtBr）やその代替品が使用されます。これが、アガロースゲル電気泳動（Agarose Gel Electrophoresis）の原理です。
アガロースではなくアガー（寒天）を用いた電気泳動の歴史は古く、1950年代後半の論文ではタンパク質の分離にアガーゲルを用いたものがあります（1）。1960年代後半には、DNAの電気泳動においてアガロースゲルの使用が有効であると報告されました（2）。
アガロースゲルの特徴（長所）はその分離幅の大きさにあります。アガロースゲルを作る際に、ゲルの濃度やバッファー（TAEまたはTBE）を変えることで、分離したい核酸の幅を操作できます。また染色試薬をゲルに含めるか（先染め）含めないか（後染め）といったプロトコルもあります。なお、塩基数が少ない核酸などで解像度高く分離を行う場合には、別のゲルである（ポリ）アクリルアミドゲルが使用されます。
アガロースゲルの作り方と、よくあるトラブル
アガロースゲルを作製するには、まずアガロースをひょう量し、それを作製したいゲル濃度に合わせた量のTAEまたはTAEバッファーに加え、電子レンジで加熱してアガロースを溶解します。溶解させたアガロースを60℃程度まで冷まし、トレイに流し込んで固めます。この作製過程において、溶解が不十分であったり、アガロース溶液を急激に冷やすと不均一なゲルができ、泳動パターンに影響することがあります。
ゲル濃度に合わせたアガロースのひょう量、バッファーの準備は手間がかかる上、ひょう量ミスによるトラブルの原因ともなり得ます。さらにEtBrは強い変異原性を持ちます。EtBrを先染め用に調製する手間や添加のタイミング（ある程度冷めてから添加する）など、一見簡単そうに見えるゲル作製であっても、注意・考慮するべき点が多くあります。
アガロースゲル作製がとても素早く簡単にできる！Bioatlas社「Atlas ClearSight Tablet」
面倒なアガロースのひょう量を無くし、毎回安定した先染め用の電気泳動用アガロースゲルを簡単に作製できるよう開発されたのが、Bioatlas社のアガロースゲル作製用タブレット（錠剤）「Atlas ClearSight Tablet」シリーズです。
このタブレットはブリスターパックに入っており、希望のゲル濃度になるよう、指定量の水またはバッファーを加えます。EtBrの代替となる低変異原性（非発がん性）核酸染色試薬「Atlas ClearSight」、またはより感度の高い核酸染色試薬「Atlas ClearSight Gold」が含まれたタブレットがあり、検出したいDNAあるいはRNA量に合わせて選択が可能です。
※「Atlas ClearSight」、「Atlas ClearSight Gold」の非発がん性はAMES試験により確認されていますが、お取扱いには十分ご注意ください
Atlas ClearSight Tabletシリーズによる簡単なアガロースゲルの作製法
(1) タブレットを溶媒に加える。
使用する溶媒量とタブレット数は、作製したいゲル濃度によって異なります。各製品のデータシートをご参考ください。温めた溶媒は使用しないでください。またゲルの厚さは0.5 cmを超えないようにしてください。
(2) 溶媒をタブレットに染みこませ、溶解する。
(3) 溶液が透明になり、粒子が全て溶けたことを目視できるまで加熱する。
(4) 60~70℃になるまで冷ました後、ゲルトレイに流し込み、固める。
Atlas ClearSight Tabletシリーズの製品詳細
■Atlas ClearSight Tablet
EtBrと異なり、低変異原性（非発がん性）で高感度（dsDNA：20 ng、ssDNA：200 ng、Total RNA：先染め250 ng、後染め100 ng）な、安全性と利便性の高い核酸染色用色素「Atlas ClearSight」を含むタブレットです。蛍光（励起波長490 nm、蛍光波長530 nm）またはUVイルミネーターで検出します。
Running Buffer（泳動バッファー）で溶解させる、バッファーを含まないタブレット、およびTAEあるいはTBEを含むタブレットがあります。
| 商品コード | 品名 | 容量 | 溶解に使用する溶媒 |
|---|---|---|---|
| アズワン品番： 83-2416-59 メーカーコード：BA50202 | Atlas ClearSight Agarose Tablet | 100錠×0.5 g | Running Buffer （泳動バッファー） |
| アズワン品番： 83-2416-60 メーカーコード：BA50203 | Atlas ClearSight Tablets with TAE | 100錠×0.5 g | 純水 |
| アズワン品番： 83-5843-57 メーカーコード：BA50204 | Atlas ClearSight Tablets with TBE | 100錠×1 g | 純水 |
■Atlas ClearSight Gold Tablet
低変異原性でAtlas ClearSightよりも高感度（DNA：0.2 ng、Total RNA：1ng）な、安全性利便性の高い核酸染色用色素（EtBr代替品）である「Atlas ClearSight Gold」が含まれたタブレットです。DNAやRNAに結合すると緑色の蛍光（励起波長~250 nmまたは~482 nm、蛍光波長~509 nm）を発します。Blue/Green LEDを用いて、アガロースゲル中のDNAおよびRNAを安全に可視化できます。
Running Buffer（泳動バッファー）で溶解させる、バッファーを含まないタブレット、および純水で溶解させる、TAEを含むタブレットがあります。
| 商品コード | 品名 | 容量 | 溶解に使用する溶媒 |
|---|---|---|---|
| アズワン品番： 83-2416-61 メーカーコード：BA50401 | Atlas ClearSight Gold Agarose Tablets | 100錠×0.5 g | Running Buffer （泳動バッファー） |
| アズワン品番： 83-5843-58 メーカーコード：BA50402 | Atlas ClearSight Gold Tablets with TAE | 100錠×0.5 g | 純水 |
Atlas ClearSight Tabletシリーズの比較
| アズワン品番 | メーカーコード | 製品 | アガロース | 染色剤 | Bufferの種類 | 検出 | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ClearSight | ClearSight Gold | TAE | TBE | UV | Blue/Green | ||||
| 83-2416-59 | BA50202 | Atlas ClearSight Agarose Tablets | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | |||
| 83-2416-60 | BA50203 | Atlas ClearSight Tablets with TAE | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | ||
| 83-5843-57 | BA50204 | Atlas ClearSight Tablets with TBE | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | ||
| 83-2416-61 | BA50401 | Atlas ClearSight Gold Agarose Tablets | 〇 | 〇 | 〇 | ||||
| 83-5843-58 | BA50402 | Atlas ClearSight Gold Agarose Tablets with TAE | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | |||
Atlas ClearSight とAtlas ClearSight Goldは単品販売もしています！
アガロースゲルで使用する核酸染色用色素（EtBr代替品）、「Atlas ClearSight」および「Atlas ClearSight Gold」は、単品でも販売しています。先染め、後染めの両方に対応しています。
| 商品コード | 品名 | 容量 |
|---|---|---|
| アズワン品番： 83-2416-81 メーカーコード：BH40501 | Atlas ClearSight DNA Stain | 1 ml |
| アズワン品番： 83-2416-82 メーカーコード：BH40701 | Atlas ClearSight Gold DNA Stain | 1 ml |
会社情報（お問い合わせ先）
| 会社名 | アズワン株式会社 |
| 部署名 | ソリューション・デザイン部 試薬グループ |
| 住所 | 〒530-0005大阪市北区中之島4丁目3番51号 Nakanoshima Qross 未来医療R＆Dセンター10階1002室 |
| TEL | 06-6447-8641 |
| FAX | 06-6447-8642 |
| Website | https://axel.as-1.co.jp/ |
| Reagents@so.as-1.co.jp |
参考文献
- ZAK B, SUN KM. Technic for separation of protein by means of agar-gel electrophoresis. Am J Clin Pathol. 1958 Jan;29(1):69-79. doi: 10.1093/ajcp/29.1_ts.69. PMID: 13508606.
- Takahashi M, Ogino T, Baba K. Estimation of relative molecular length of DNA by electrophoresis in agarose gel. Biochim Biophys Acta. 1969 Jan 21;174(1):183-7. doi: 10.1016/0005-2787(69)90241-x. PMID: 4885691.
