PCR-DNA-Extraction

新型コロナウイルス感染判定法の一つとして，PCR（ポリメラーゼ連鎖反応，Polymerase Chain Reaction）法は広く一般にも知られることとなりました。

PCR法とは，鋳型となるDNA（デオキシリボ核酸）を用意し，その鋳型DNAを基に酵素と配列の素からDNAを増やしていく方法です。
（RNAしかないコロナウイルスの場合は，RNAからDNAに変換する「逆転写」を経てからPCRを行います。）

DNAの抽出方法には，

  • 有機溶媒を使用する方法
  • スピンカラムを使用する方法
  • マグネットビーズを使用する方法
  • 核酸自動抽出装置を使用する方法

など，いくつかの方法があります。

どの方法を選択するか―これはDNAを抽出した後にどのような分析，先の実験をするかによっても異なります。
その理由は「得られるDNA精製度」の違いです。

例えばDNAの配列を読む必要がある場合（シークエンシング）は精製されたDNAを用意する必要があります。これを行わないと，解析中のバックグラウンドの増加やシグナルの低下などのトラブルの原因になります。

しかし時間やコストを考え，例えば「目的遺伝子が導入されたか調べる」「品種の同定」などで，単純にPCR用の鋳型DNA（DNAテンプレート）が欲しい場合は，簡単にそれらを抽出できるキットを使用してその目的を達成することができます。

今回はそのようなPCR用の鋳型DNAを「簡単」「迅速」に抽出できる製品（国内メーカー限定！）を特集しました。

※各製品の情報は，各社ウェブサイトより引用しています。詳細なデータ，最新の製品情報は各社ウェブサイトをご確認下さい。

GenCheck® DNA Extraction Reagent (株式会社ファスマック）

遺伝子合成，シークエンス解析などの受託サービスを提供する，株式会社ファスマックが販売している製品が「GenCheck® DNA Extraction Reagent」。
1液組成とシンプルな構成ながら，幅広い試料に対応しています。

そして同社のキャラクター「ファスマック太郎」はTwitterで大人気。

株式会社ファスマックさん (@fasmac_taro) / Twitter

特長

  • ワンチューブで抽出が可能
  • 作業：熱処理と遠心分離
  • 操作時間：約15分間
  • 1液組成
  • サンプルあり

適用試料

種子，グラム陽性細菌，グラム陰性細菌，カビ，酵母，動物組織，血液

実験例（種子からのDNA抽出とPCR結果）

GenCheck® DNA Extraction Reagentで「種子」から抽出したDNA溶液を用いたPCR結果
・ 酵素：MightyAmp DNA Polymerase Ver II
・ プライマー：植物異物同定用プライマー ※株式会社ファスマック製
・ 抽出液の希釈倍率 ： 原液
・ DNA鋳型量[μL] total25 μ L：2.5

1 トウモロコシ
Z.mays		2 ダイコン
R.sativus		3 ナタネ
B.nupus		4 ハクサイ
B. rapa var.pekinen		5 オクラ
A.esculentus		6 ホウレンソウ
S.oleracea		7 レタス
L.sativa		8 エンドウ
P.sativum
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商品情報

商品コード製品名容量保存
GC001-1NGenCheck® DNA Extraction Reagent20ml冷蔵

メーカーサイト及び情報引用元：試薬キット販売　GenCheck® DNA Extraction Reagent 【 FASMAC 】

※画像は株式会社ファスマック様よりご許可を頂き、掲載しております。

カネカ簡易DNA抽出キットversion2（株式会社カネカ）

医療，食品，素材分野などに事業展開する株式会社カネカ。同社が販売しているのが「カネカ簡易DNA抽出キットversion2」。

2液組成・室温保存可能という点がユニーク。適用試料も幅広い。

特長

  • 作業：インキュベート
  • 操作時間：約10分間
  • 保存温度；室温
  • 2液組成

適用試料

動物組織（マウステール、皮膚、軟骨、肝臓、脾臓、腎臓、耳、心臓、肺、脳など各種臓器），植物組織（葉、根、茎、種），細菌・真菌，ウイルス，血液，細胞，糞便

実験例（ノックアウトマウスの尾からのDNA抽出）

商品情報

商品コード 製品名容量保存
KN-T110005カネカ簡易DNA抽出キットversion250 test室温

メーカーサイト及び情報引用元 ：カネカ簡易DNA抽出キットversion2

※画像は株式会社カネカ様よりご許可を頂き、掲載しております。

シカジーニアス® DNA抽出試薬（関東化学株式会社）

医薬品中間体，化成品，臨床検査薬，試薬などで，研究・開発・生産に有用な製品を多く製造開発する関東化学株式会社。同社が提供するのが，「シカジーニアス® DNA抽出試薬」。

「培養液からも抽出可能」という点がユニーク。なおサンプルによって製品が分かれています。

特長

  • 作業：インキュベート
  • 操作時間：約10分間
  • 保存温度；冷蔵
  • 2液組成
  • 培養液からも抽出可能
  • サンプルあり

適用試料

グラム陽性細菌，グラム陰性細菌，動物組織（抽出試薬AN），酵母（抽出試薬ST）

商品情報

商品コード製品名容量保存
08178-96シカジーニアス ® DNA抽出試薬
Cica geneus ® DNA extraction reagent		1pack(120回分)冷蔵
08199-96 シカジーニアス ® DNA抽出試薬AN
Cica geneus ® DNA extraction reagent AN		 1pack(120回分) 冷蔵
08210-96 シカジーニアス ® DNA抽出試薬ST
Cica geneus ® DNA extraction reagent ST		 1pack(120回分) 冷蔵

メーカーサイト及び情報引用元 ：シカジーニアス® DNA抽出試薬 | 核酸抽出

まとめ

いかがでしたでしょうか。各社が様々な工夫をして，簡単かつスピーディーにDNA抽出できるよう製品を開発しています。ご自身の目的に合うようでしたら，お試ししてみてはいかがでしょうか。